Stéphane Roy a obtenu des prix aux concours suivants:
- Concorso internazionale Luigi Russolo di musica elettroacustica, Varèse (Italie): 1989, 1991, 1992
- Concours international de musique électroacoustique de Bourges, Bourges (Cher, France): 1991
- Concours national des jeunes compositeurs de Radio-Canada, Canada: 1988
- NEWCOMP International Computer Music Competition, Boston (Massachusetts, ÉU): 1989
- Prix Ars Electronica, Linz (Autriche): 1992
- Prix international Noroit-Léonce Petitot de composition musicale acousmatique, Arras (Pas-de-Calais, France): 1993
- Prix Opus, Québec: 2004, 2020